Catálogo de servicios del clúster HPC ctcomp2
(Volver a la Guía de usuario del clúster HPC ctcomp2)
Under continuous construction…
Compiladores
GCC
| http://gcc.gnu.org/ | |
| Versión | $ gcc --version gcc (Debian 4.7.2-4) 4.7.2 |
|---|---|
| Módulo | - (nativo del sistema) |
<html> </html>
Java
| http://www.java.com/es/download/ | |
| Versión | $ java -versionjava version "1.7.0_07" Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_07-b10) Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.3-b01, mixed mode) |
|---|---|
| Módulo | module load jdk |
<html>
</html>
Python
| http://www.python.org/ | |
| Versión | $ python --versionPython 2.7.3rc2 |
|---|---|
| Módulo | - (nativo del sistema) |
 Paquetes | En en sistema solo está instalado el sistema base: Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME (Información en la página de documentación) |
<html>
</html>
Librerías computacionales
MATLAB
| http://www.mathworks.es/products/matlab/ | |
| Versión | R2011a |
|---|---|
| R2012a | |
| Módulo | module load matlab/R2011a module load matlab/R2012a |
| Versión por defecto: R2011a (Hay más licencias 2011, como se explica en ATIC USC) |
|
| Comentarios | Es posible que ejecuciones largas aparezca el siguiente warning:Your MATLAB session has timed out. All license keys have been returned.Aparentemente, este warning no afecta a las ejecuciones activas de MATLAB. |
<html> </html>
Octave
| http://www.mathworks.es/products/matlab/ | |
| Versión | 3.6.2 |
|---|---|
| Módulo | - (nativo del sistema) |
| Comentarios | En en sistema solo está instalado el sistema base: Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME (Información en la página de documentación) |
<html> </html>
R
| http://cran.r-project.org/ | |
| Versión | 2.15.2 |
|---|---|
| Módulo | module load R/2.15.2 |
| Paquetes | En en sistema solo está instalado el sistema base: Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME. (Información en la página de documentación) |
<html> </html>
ACML (AMD Core Math Library)
| http://developer.amd.com/tools/cpu-development/amd-core-math-library-acml/ | |
| Versión | 5.2.0_64 gfortran (compilador GCC) |
|---|---|
| Módulo | module load acml/5.2.0_64 module load acmlacml/5.2.0_64_fma4 module load acmlacml/5.2.0_64_mp module load acmlacml/5.2.0_64_mp_fma4 |
Versión por defecto: acml/5.2.0_64 |
|
| Comentarios | mp: multiprocessor fma4: fused multiply–add (FMA) operations (wikipedia) Versiones incompatibles (sólo uno de los módulos puede estar activo) El frontend no soporta FMA4 |
<html> </html>
FFTW
WFDB
| http://www.physionet.org/physiotools/wfdb.shtml | |
| Versión | 10.5.18 |
|---|---|
| Módulo | module load wfdb |
<html>
</html>
Liberías de paso de mensajes
Open MPI
MPICH
| http://www.mpich.org http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1-old/ |
|
| Versiones | MPICH2 1.4.1 MPICH1 1.2.7p1 |
|---|---|
| Módulo | module load mpich/1.4.1 mpich/1.2.7p1 |
Versión por defecto: mpich/1.4.1 |
|
<html>
</html>
Simuladores
TCAD-ATLAS (Silvaco)
| http://www.silvaco.com/products/device_simulation/atlas.html | |
| Versión | 2012 |
|---|---|
| Módulo | module load silvaco-tcad |
<html>
</html>
SENTAURUS (Synopsys)
| http://www.synopsys.com/Tools/TCAD/Pages/default.aspx | |
| Versiones | D_2010.03 y G_2012.06-SP1 |
|---|---|
| Módulo | module load synopsys-sentaurus/D_2010.03 module load synopsys-sentaurus/G_2012.06-SP1 |
Versión por defecto: synopsys-sentaurus/D_2010.03 |
|
<html>
</html>
IC Design (CADENCE)
| http://www.cadence.com/products/cic/Pages/default.aspx | |
| Versiones | 6.1.5 (2012-2013) |
|---|---|
| Módulo | module load cadence |
| Comentarios | Antes de arrancar ocean es necesario ejecutarsource /optct/cadence/2012-2013/lnx86/cadence.bash y arrancar ocean dentro de un entorno de X simuladoxvfb-run -a -n 80 -s “-screen 0 640x480x16” ocean < script.ocn(Información en la página de documentación) |
<html>
</html>
Administración
Modules
| http://modules.sourceforge.net/ | |
| Versión | 3.2.9c |
|---|---|