Diferencias
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| es:centro:servizos:hpc [2017/06/17 20:55] – jorge.suarez | es:centro:servizos:hpc [2025/12/05 10:05] (actual) – fernando.guillen | ||
|---|---|---|---|
| Línea 1: | Línea 1: | ||
| - | ====== Computación de Altas Prestaciones | + | ====== |
| + | [[ https:// | ||
| + | ===== Descripción | ||
| + | El clúster está compuesto en la parte de cómputo por: | ||
| + | * 9 servidores para cómputo general. | ||
| + | * 1 "fat node" para trabajos que requieran mucha memoria. | ||
| + | * 6 servidores para computo con GPU. | ||
| + | |||
| + | Los usuarios solo tienen acceso directo al nodo de login, de prestaciones más limitadas y que no debe usarse para computar. \\ | ||
| + | Todos los nodos están interconectados por una red a 10Gb. \\ | ||
| + | Hay un almacenamiento distribuido accesible desde todos los nodos con 220 TB de capacidad conectado mediante una doble red de fibra de 25Gb. \\ | ||
| + | \\ | ||
| + | ^ Nombre | ||
| + | | hpc-login2 | ||
| + | | hpc-node[1-2] | ||
| + | | hpc-node[3-9] | ||
| + | | hpc-fat1 | ||
| + | | hpc-gpu[1-2] | ||
| + | | hpc-gpu3 | ||
| + | | hpc-gpu4 | ||
| + | | hpc-gpu5 | ||
| + | | hpc-gpu6 | ||
| - | ===== Acceso al cluster y copia de archivos ===== | ||
| - | El acceso se hace a través de una máquina que actúa como //frontend// a través de //ssh//. Para más información, | + | ===== Conexión al sistema ===== |
| + | Para acceder al clúster, hay que solicitarlo previamente | ||
| - | Antes de acceder por primera vez, lee atentamente la sección de introducción que sigue para entender cómo funciona el sistema. También encontrarás información que te servirá de referencia más adelante. | + | El acceso se realiza mediante una conexión SSH al nodo de login (172.16.242.211): |
| + | <code bash> | ||
| + | ssh < | ||
| + | </ | ||
| - | ===== Introducción | + | ===== |
| + | <note warning> No se hace copia de seguridad de ninguno de los sistemas de ficheros del cluster!!</ | ||
| + | El HOME de los usuarios en el cluster está en el sistema compartido de ficheros, por lo que es accesible desde todos los nodos del cluster. Ruta definida en la variable de entorno %%$HOME%%. \\ | ||
| + | Cada nodo tiene una partición local de 1 TB para scratch, que se borra al terminar cada trabajo. Se puede acceder mediante la variable de entorno %%$LOCAL_SCRATCH%% en los scripts. \\ | ||
| + | Para datos que deban ser compartidos por grupos de usuarios, hay que solicitar la creación de una carpeta en el almacenamiento compartido que solo será accesible por los miembros del grupo.\\ | ||
| + | ^ Directorio | ||
| + | | Home | %%$HOME%% | ||
| + | | Scratch local | ||
| + | | Carpeta de grupo | %% $GRUPOS/< | ||
| + | %%* el almacenamiento es compartido%% | ||
| + | === AVISO IMPORTANTE === | ||
| + | El sistema compartido de archivos tiene un mal rendimiento cuando trabaja con muchos archivos de tamaño pequeño. Para mejorar el rendimiento en ese tipo de escenarios hay que crear un sistema de archivos en un fichero de imagen y montarlo para trabajar directamente sobre él. El procedimiento es el siguiente: | ||
| + | * Crear el fichero de imagen en tu home: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## truncate image.name -s SIZE_IN_BYTES | ||
| + | truncate ejemplo.ext4 -s 20G | ||
| + | </ | ||
| + | * Crear un sistema de archivos en el fichero de imagen: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## mkfs.ext4 -T small -m 0 image.name | ||
| + | ## -T small opciones optimizadas para archivos pequeños | ||
| + | ## -m 0 No reservar espacio para root | ||
| + | mkfs.ext4 -T small -m 0 ejemplo.ext4 | ||
| + | </ | ||
| + | * Montar la imagen (usando SUDO) con el script | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## Por defecto queda montada en / | ||
| + | sudo mount_image.py ejemplo.ext4 | ||
| + | </ | ||
| + | * Para desmontar la imagen usar el script // | ||
| + | <code bash> | ||
| + | sudo umount_image.py | ||
| + | </ | ||
| + | <note warning> | ||
| + | El fichero solo puede montarse desde un único nodo si se hace en modo readwrite, pero puede montarse desde cualquier número de nodos en modo readonly. | ||
| + | </ | ||
| + | El script de montaje tiene estas opciones: | ||
| + | < | ||
| + | --mount-point path < | ||
| + | --rw <-- (opcional)Por defecto se monta readonly, con esta opción se monta readwrite. | ||
| + | </ | ||
| + | El script de desmontaje tiene estas opciones: | ||
| + | < | ||
| + | --mount-point | ||
| + | </ | ||
| + | ===== Transferencia de ficheros y datos ===== | ||
| + | === SCP === | ||
| + | Desde tu máquina local al cluster: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | scp filename < | ||
| + | </ | ||
| + | Desde el cluster a tu máquina local: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | scp filename < | ||
| + | </ | ||
| + | [[https:// | ||
| + | === SFTP === | ||
| + | Para transferir múltiples archivos o para navegar por el sistema de archivos. | ||
| + | <code bash> | ||
| + | < | ||
| + | sftp> | ||
| + | sftp> ls | ||
| + | sftp> cd < | ||
| + | sftp> put < | ||
| + | sftp> get < | ||
| + | sftp> quit | ||
| + | </ | ||
| + | [[https:// | ||
| + | === RSYNC === | ||
| + | [[ https:// | ||
| + | === SSHFS === | ||
| + | Requiere la instalación del paquete sshfs.\\ | ||
| + | Permite por ejemplo montar el home del equipo del usuario en hpc-login2: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## Montar | ||
| + | sshfs < | ||
| + | ## Desmontar | ||
| + | fusermount -u < | ||
| + | </ | ||
| + | [[https:// | ||
| - | ==== Funcionamiento básico de un clúster de computación | + | ===== Software disponible |
| + | Todos los nodos tienen el software básico que se instala por defecto con AlmaLinux 8.4, particularmente: | ||
| + | * GCC 8.5.0 | ||
| + | * Python 3.6.8 | ||
| + | * Perl 5.26.3 | ||
| + | En los nodos con GPU, además: | ||
| + | * nVidia Driver 560.35.03 | ||
| + | * CUDA 11.6 | ||
| + | * libcudnn 8.7 | ||
| + | Para usar cualquier otro software no instalado en el sistema u otra versión del mismo hay tres opciones: | ||
| + | - Usar Modules con los módulos que ya están instalados (o solicitar la instalación de un nuevo módulo si no está disponible) | ||
| + | - Usar un contenedor (uDocker o Apptainer/ | ||
| + | - Usar Conda | ||
| + | Un módulo es la solución más sencilla para usar software sin modificaciones o dependencias difíciles de satisfacer.\\ | ||
| + | Un contenedor es ideal cuando las dependencias son complicadas y/o el software está muy personalizado. También es la mejor solución si lo que se busca es reproducibilidad, | ||
| + | Conda es la mejor solución si lo que se necesita es la última versión de una librería o programa o paquetes no disponibles de otra forma.\\ | ||
| - | El Cluster de Computación de Altas Prestaciones (HPC, //High Performance Computing// | ||
| - | Un **cluster | + | ==== Uso de modules/ |
| + | [[ https:// | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Ver los módulos disponibles: | ||
| + | module avail | ||
| + | # Cargar | ||
| + | module < | ||
| + | # Descargar un módulo: | ||
| + | module unload < | ||
| + | # Ver módulos cargados en tu entorno: | ||
| + | module list | ||
| + | # Puede usarse ml como abreviatura del comando module: | ||
| + | ml avail | ||
| + | # Para obtener información sobre un módulo: | ||
| + | ml spider < | ||
| + | </ | ||
| - | Un **sistema de gestión de colas** (//SGC//) es un software que planifica la ejecución de los trabajos que se encuentra habitualmente en los sistemas de este tipo, ya que permite una gestión eficiente de los recursos con múltiples usuarios. En este clúster está instalado el sistema **PBS/ | ||
| - | La dinámica de funcionamiento de un sistema de este tipo es la siguiente: | ||
| - | - El usuario solicita la ejecución de una tarea((Normalmente un script de //bash//)) con unos recursos determinados. | ||
| - | - El sistema registra la solicitud en una de sus colas de entrada((Típicamente //batch//)) y, según la cantidad de recursos solicitados, | ||
| - | - En función de la prioridad de la cola de sistema (a menores recursos necesarios, mayor prioridad) y de la disponibilidad de los recursos en el sistema, la tarea se enviará a uno o varios de los nodos computacionales. Al terminar la ejecución, se devolverá la salida generada. | ||
| - | Lo habitual es que la ejecución tenga que **esperar en la cola** hasta que los recursos estén disponibles y preparados. Además, resulta imposible realizar | + | ==== Ejecución de contenedores de software ==== |
| + | === uDocker ==== | ||
| + | [[ https:// | ||
| + | uDocker está instalado como un módulo, así que es necesario cargarlo | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ml udocker | ||
| + | </ | ||
| - | ==== Descripción del hardware ==== | + | === Apptainer/ |
| - | El clúster **ctcomp2** es un clúster heterogéneo, | + | [[ https://apptainer.org/docs/user/1.4/ | Documentacion de Apptainer ]] \\ |
| + | Apptainer está instalado en el sistema de cada nodo, por lo que no es necesario hacer nada para usarlo. | ||
| - | ^ Nombre del nodo ^ Modelo ^ Núcleos por nodo (NUMAs, Sockets, Cores/ | ||
| - | | node1-7 | HP Proliant BL685c G7 | 64 (8, 4, 8, 2) | 256GB((node1 128GB)) | | ||
| - | | inode11-15 | Dell PowerEdge M910 | 64 (4, 4, 8, 1) | 64GB | | ||
| - | | inode16-20 | Dell PowerEdge M620 | 32 (2, 2, 8, 2) | 64GB | | ||
| - | Internamente los nodos computacionales están conectados entre sí a través | + | ==== CONDA ==== |
| + | [[ https:// | ||
| + | Miniconda es la versíon mínima de Anaconda y solo incluye el gestor de entornos conda, Python y unos pocos paquetes necesarios. A partir de ahí cada usuario solo descarga e instala los paquetes que necesita. | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Obtener miniconda | ||
| + | wget https:// | ||
| + | # Instalarlo | ||
| + | bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh | ||
| + | # Inicializar miniconda para el shell bash | ||
| + | ~/ | ||
| + | </ | ||
| + | ===== Uso de SLURM ===== | ||
| + | El gestor de colas en el cluster | ||
| + | <note tip>El término CPU identifica a un core físico | ||
| + | == Recursos disponibles == | ||
| + | <code bash> | ||
| + | hpc-login2 ~]# ver_estado.sh | ||
| + | ============================================================================================================= | ||
| + | NODO | ||
| + | ============================================================================================================= | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | ============================================================================================================= | ||
| + | TOTALES: [Cores : 3/688] [Mem(MB): 270000/ | ||
| - | Casi todos los nodos, a excepción de // | + | hpc-login2 ~]$ sinfo -e -o " |
| + | # Hay un alias para este comando: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ ver_recursos | ||
| + | NODELIST | ||
| + | hpc-fat1 | ||
| + | hpc-gpu[1-2] | ||
| + | hpc-gpu3 | ||
| + | hpc-gpu4 | ||
| + | hpc-gpu[5-6] | ||
| + | hpc-node[1-2] | ||
| + | hpc-node[3-9] | ||
| - | [[ es:centro:servizos:hpc:referencia_bios|Información técnica | + | # Para ver el uso actual de los recursos: (CPUS (Allocated/ |
| - | ==== Descripción del software | + | hpc-login2 ~]$ sinfo -N -r -O NodeList, |
| - | El sistema operativo es //Debian GNU/Linux 8.6 (jessie)//. | + | # Hay un alias para este comando: |
| + | hpc-login2 ~]$ ver_uso | ||
| + | NODELIST | ||
| + | hpc-fat1 | ||
| + | hpc-gpu1 | ||
| + | hpc-gpu2 4/ | ||
| + | hpc-gpu3 | ||
| + | hpc-gpu4 | ||
| + | hpc-gpu5 | ||
| + | hpc-gpu6 | ||
| + | hpc-node1 | ||
| + | hpc-node2 | ||
| + | hpc-node3 | ||
| + | hpc-node4 | ||
| + | hpc-node5 | ||
| + | hpc-node6 | ||
| + | hpc-node7 | ||
| + | hpc-node8 | ||
| + | hpc-node9 | ||
| + | </ | ||
| + | ==== Nodos ==== | ||
| + | Un nodo es la unidad | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Mostrar la información | ||
| + | hpc-login2 ~]$ scontrol show node hpc-node1 | ||
| + | NodeName=hpc-node1 Arch=x86_64 CoresPerSocket=18 | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | Gres=(null) | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | </ | ||
| + | ==== Particiones ==== | ||
| + | Las particiones en SLURM son grupos lógicos de nodos. En el cluster hay una única partición a la que pertenecen todos los nodos, por lo que no es necesario especificarla a la hora de enviar trabajos. | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Mostrar la información de las particiones: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sinfo | ||
| + | defaultPartition* | ||
| + | # Cuando se incorporen al cluster ctgpgpu7 y 8 apareceran como los nodos hpc-gpu1 y 2 respectivamente. | ||
| + | </ | ||
| + | ==== Trabajos ==== | ||
| + | Los trabajos en SLURM son asignaciones de recursos a un usuario durante un tiempo determinado. Los trabajos se identifican por un número correlativo o JOBID. \\ | ||
| + | Un trabajo | ||
| - | El sistema | + | ==== Sistema |
| + | La cola a la que se envíe cada trabajo define la prioridad,los límites y también el " | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Mostrar las colas | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sacctmgr show qos | ||
| + | # Hay un alias que muestra solo la información más relevante: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ ver_colas | ||
| + | Name | ||
| + | ---------- ---------- ------------------------------ ----------- -------------------- --------- ----------- | ||
| + | | ||
| + | interacti+ | ||
| + | urgent | ||
| + | long 100 gres/ | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | </ | ||
| + | # Priority: es la prioridad relativa de cada cola. \\ | ||
| + | # DenyonLimit: | ||
| + | # UsageFactor: | ||
| + | # MaxTRES: límites | ||
| + | # MaxWall: tiempo máximo que puede estar el trabajo en ejecución \\ | ||
| + | # MaxTRESPU: límites globales por usuario \\ | ||
| + | # MaxJobsPU: Número máximo de trabajos que un usuario puede tener en ejecución. \\ | ||
| + | # MaxSubmitPU: | ||
| + | |||
| + | ==== Envío de un trabajo al sistema de colas ==== | ||
| + | == Especificación de recursos == | ||
| + | Por defecto, si se envía un trabajo sin especificar nada el sistema lo envia a la QOS por defecto (regular) y le asigna un nodo, una CPU y 4 GB de RAM. El límite de tiempo | ||
| + | Esto es muy ineficiente, | ||
| + | - %%El número de nodos (-N o --nodes), tareas (-n o --ntasks) y/o CPU por tarea (-c o --cpus-per-task).%% | ||
| + | - %%La memoria (--mem) por nodo o la memoria por cpu (--mem-per-cpu).%% | ||
| + | - %%El tiempo estimado de ejecución del trabajo ( --time )%% | ||
| - | * [[http:// | + | A mayores puede ser interesante añadir los siguientes parámetros: |
| - | | + | | -J |
| - | | + | | -q |
| + | | -o | ||
| + | | | ||
| + | | -C | ||
| + | | | %%--exclusive%% | ||
| + | | -w | %%--nodelist%% | ||
| - | El sistema permite compilar y ejecutar código | + | == Cómo se asignan los recursos == |
| - | ===== Sistema de colas ===== | + | Por defecto el método de asignación entre nodos es la asignación en bloque ( se asignan todos los cores disponibles |
| - | El sistema de colas tiene cuatro **colas | + | == Calculo de la prioridad == |
| + | Cuando se envía un trabajo al sistema de colas, lo primero que ocurre es que se comprueba si los recursos solicitados entran dentro de los límites fijados en la cola correspondiente. Si supera alguno se cancela el envío. \\ | ||
| + | Si hay recursos disponibles el trabajo se ejecuta directamente, | ||
| + | El fairshare es un cálculo dinámico que hace SLURM para cada usuario y es la diferencia entre los recursos asignados y los recursos consumidos | ||
| + | <code bash> | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sshare -l | ||
| + | User RawShares | ||
| + | ---------- ---------- ----------- ----------- ----------- | ||
| + | | ||
| + | 1 0.500000 | ||
| + | user_name | ||
| + | </ | ||
| + | # RawShares: es la cantidad | ||
| + | # NormShares: Es la cantidad anterior normalizada a los recursos | ||
| + | # RawUsage: Es la cantidad de segundos/ | ||
| + | # NormUsage: Cantidad anterior normalizada al total de segundos/ | ||
| + | # FairShare: El factor FairShare entre 0 y 1. Cuanto mayor uso del cluster, más se aproximará | ||
| - | Para enviar un trabajo al sistema | + | == Envío |
| + | - sbatch | ||
| + | - salloc | ||
| + | - srun | ||
| - | ^ Cola ^ Número máximo de trabajos encolados((Solo cuentan los trabajos que no han sido aún enviados a una cola del sistema, así que esto no quiere decir que solo puedas enviar ese número de trabajos)) ^ Características ^ Ejemplo ^ | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | Los recursos que se pueden solicitar y que determinarán la cola del sistema | + | 1. SBATCH \\ |
| + | Sirve para enviar un script al sistema | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Crear el script: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ vim trabajo_ejemplo.sh | ||
| + | # | ||
| + | #SBATCH --job-name=prueba | ||
| + | #SBATCH --nodes=1 | ||
| + | #SBATCH --ntasks=1 | ||
| + | #SBATCH --cpus-per-task=1 | ||
| + | #SBATCH --mem=1gb | ||
| + | #SBATCH --time=00: | ||
| + | #SBATCH --qos=urgent | ||
| + | #SBATCH --output=prueba_%j.log | ||
| - | * El número | + | echo "Hello World!" |
| - | | + | |
| - | | + | hpc-login2 ~]$ sbatch trabajo_ejemplo.sh |
| + | </ | ||
| + | 2. SALLOC \\ | ||
| + | Sirve para obtener de forma inmediata una asignación | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Obtener 5 nodos y lanzar un trabajo. | ||
| + | hpc-login2 ~]$ salloc -N5 myprogram | ||
| + | # Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso): | ||
| + | hpc-login2 ~]$ salloc -N1 | ||
| + | # Obtener acceso interactivo a un nodo DE FORMA EXCLUSIVA | ||
| + | hpc-login2 ~]$ salloc -N1 --exclusive | ||
| + | </ | ||
| + | 3. SRUN \\ | ||
| + | Sirve para lanzar un trabajo paralelo ( es preferible a usar mpirun ). Es interactivo y bloqueante. | ||
| + | <code bash> | ||
| + | # Lanzar un hostname en 2 nodos | ||
| + | hpc-login2 ~]$ srun -N2 hostname | ||
| + | hpc-node1 | ||
| + | hpc-node2 | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==== Uso de los nodos con GPU ==== | ||
| + | Para solicitar específicamente una asignación de GPUs para un trabajo hay que añadir a sbatch o srun las opciones: | ||
| + | | %%--gres%% | ||
| + | | %%--gpus o -G%% | Solicitud de gpus por JOB | %%--gpus=[type]: | ||
| + | También existen las opciones %% --gpus-per-socket, | ||
| + | Ejemplos: | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## Ver la lista de nodos y gpus: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ ver_recursos | ||
| + | ## Solicitar 2 GPU cualesquiera para un JOB, añadir: | ||
| + | --gpus=2 | ||
| + | ## Solicitar una A100 de 40G en un nodo y una A100 de 80G en otro, añadir: | ||
| + | --gres=gpu: | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==== Monitorización de los trabajos ==== | ||
| + | <code bash> | ||
| + | ## Listado de todos los trabajos en la cola | ||
| + | hpc-login2 ~]$ squeue | ||
| + | ## Listado de los trabajos de un usuario | ||
| + | hpc-login2 ~]$ squeue -u < | ||
| + | ## Cancelar un trabajo: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ scancel < | ||
| + | ## Lista de trabajos recientes | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sacct -b | ||
| + | ## Información histórica detallada de un trabajo: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sacct -l -j < | ||
| + | ## Información de debug de un trabajo para troubleshooting: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ scontrol show jobid -dd < | ||
| + | ## Ver el uso de recursos de un trabajo en ejecución: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ sstat < | ||
| + | |||
| + | </ | ||
| + | ==== Controlar la salida de los trabajos ==== | ||
| + | == Códigos de salida == | ||
| + | Por defecto estos son los códigos de salida de los comandos: | ||
| + | ^ SLURM command | ||
| + | | salloc | ||
| + | | srun | | ||
| + | | sbatch | ||
| + | |||
| + | == STDIN, STDOUT y STDERR == | ||
| + | **SRUN: | ||
| + | Por defecto stdout y stderr se redirigen de todos los TASKS a el stdout y stderr de srun, y stdin se redirecciona desde el stdin de srun a todas las TASKS. Esto se puede cambiar con: | ||
| + | | %%-i, --input=< | ||
| + | | %%-o, --output=< | ||
| + | | %%-e, --error=< | ||
| + | Y las opciones son: | ||
| + | * //all//: opción por defecto. | ||
| + | * //none//: No se redirecciona nada. | ||
| + | * //taskid//: Solo se redirecciona desde y/o al TASK id especificado. | ||
| + | * // | ||
| + | * //filename pattern//: Igual que filename pero con un fichero definido por un [[ https:// | ||
| + | |||
| + | **SBATCH: | ||
| + | Por defecto "/ | ||
| + | | %%-i, --input=< | ||
| + | | %%-o, --output=< | ||
| + | | %%-e, --error=< | ||
| + | La referencia de filename_pattern está [[ https:// | ||
| + | |||
| + | ==== Envío de correos ==== | ||
| + | Se pueden configurar los JOBS para que envíen correos en determinadas circunstancias usando estos dos parámetros (**SON NECESARIOS AMBOS**): | ||
| + | | %%--mail-type=< | ||
| + | | %%--mail-user=< | ||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | ==== Estados de los trabajos en el sistema de colas ==== | ||
| + | <code bash> | ||
| + | hpc-login2 ~]# squeue -l | ||
| + | JOBID PARTITION | ||
| + | 6547 defaultPa | ||
| + | |||
| + | ## Ver estado de uso de las colas del cluster: | ||
| + | hpc-login2 ~]$ estado_colas.sh | ||
| + | JOBS PER USER: | ||
| + | -------------- | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | |||
| + | JOBS PER QOS: | ||
| + | -------------- | ||
| + | | ||
| + | long: 1 | ||
| + | |||
| + | JOBS PER STATE: | ||
| + | -------------- | ||
| + | | ||
| + | | ||
| + | ========================================== | ||
| + | Total JOBS in cluster: | ||
| + | </ | ||
| + | Estados (STATE) más comunes de un trabajo: | ||
| + | * R RUNNING Job currently has an allocation. | ||
| + | * CD COMPLETED Job has terminated all processes on all nodes with an exit code of zero. | ||
| + | * F FAILED Job terminated with non-zero exit code or other failure condition. | ||
| + | * PD PENDING Job is awaiting resource allocation. | ||
| + | |||
| + | [[ https:// | ||
| + | |||
| + | Si un trabajo no está en ejecución aparecerá una razón debajo de REASON:[[ https:// | ||
| - | La memoria máxima asignada depende de la cola del sistema que se utilice finalmente, así que estará determinada por el resto de parámetros. | ||
| - | Los recursos pueden solicitarse de dos formas: como comentarios al inicio del script, o con el parámetro '' | ||
| - | Comprueba los límites existentes en las colas del sistema, para determinar la mejor elección de recursos posible((Si pides una situación imposible, por ejemplo, 8 núcleos con 200 horas, el trabajo permanecerá en la cola de entrada y jamás se llegará a ejecutar)): | ||
| - | ^ ^ Límites | ||
| - | ^ Cola ^ Núcleos((parámetro '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | | '' | ||
| - | Puedes leer más sobre [[es: | ||