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centro:servizos:hpc [2022/07/01 12:20] – fernando.guillencentro:servizos:hpc [2022/09/08 16:53] – [Descripción] fernando.guillen
Liña 17: Liña 17:
 |  hpc-node[3-9]             |  Dell R740   |  2 x Intel Xeon Gold 5220R @2,2 GHz (24c)       |  192 GB   |  -                           | |  hpc-node[3-9]             |  Dell R740   |  2 x Intel Xeon Gold 5220R @2,2 GHz (24c)       |  192 GB   |  -                           |
 |  hpc-fat1                  |  Dell R840   |  4 x Xeon Gold 6248 @ 2.50GHz (20c)             |  1 TB     |  -                           | |  hpc-fat1                  |  Dell R840   |  4 x Xeon Gold 6248 @ 2.50GHz (20c)             |  1 TB     |  -                           |
-|  <del>hpc-gpu1</del>*  |  Dell R740   |  2 x Intel Xeon Gold 5220 CPU @ 2.20GHz (18c)   |  192 GB   |  2x Nvidia Tesla V100S       | +|  hpc-gpu[1-2]  |  Dell R740   |  2 x Intel Xeon Gold 5220 CPU @ 2.20GHz (18c)   |  192 GB   |  2x Nvidia Tesla V100S       |
-|  hpc-gpu2  |  Dell R740   |  2 x Intel Xeon Gold 5220 CPU @ 2.20GHz (18c)   |  192 GB   |  2x Nvidia Tesla V100S       |+
 |  hpc-gpu3                  |  Dell R7525  |  2 x AMD EPYC 7543 @2,80 GHz (32c)              |  256 GB   |  2x Nvidia Ampere A100 40GB  | |  hpc-gpu3                  |  Dell R7525  |  2 x AMD EPYC 7543 @2,80 GHz (32c)              |  256 GB   |  2x Nvidia Ampere A100 40GB  |
 |  hpc-gpu4                  |  Dell R7525  |  2 x AMD EPYC 7543 @2,80 GHz (32c)              |  256 GB   |  1x Nvidia Ampere A100 80GB  | |  hpc-gpu4                  |  Dell R7525  |  2 x AMD EPYC 7543 @2,80 GHz (32c)              |  256 GB   |  1x Nvidia Ampere A100 80GB  |
-* Es ctgpgpu8. Se integrará próximamente en cluster.+
 ===== Conexión al sistema ===== ===== Conexión al sistema =====
 Para acceder al clúster, hay que solicitarlo previamente a través de [[https://citius.usc.es/uxitic/incidencias/add|formulario de incidencias]]. Los usuarios que no tengan permiso de acceso recibirán un mensaje de "contraseña incorrecta". Para acceder al clúster, hay que solicitarlo previamente a través de [[https://citius.usc.es/uxitic/incidencias/add|formulario de incidencias]]. Los usuarios que no tengan permiso de acceso recibirán un mensaje de "contraseña incorrecta".
Liña 296: Liña 295:
  
 == Envío de trabajos == == Envío de trabajos ==
 +  - sbatch
   - salloc   - salloc
   - srun   - srun
-  - sbatch 
  
-1. SALLOC \\ + 
-Sirve para obtener de forma inmediata una asignación de recursos (nodos). En cuanto se obtiene se ejecuta el comando especificado o una shell en su defecto.  +1. SBATCH \\
-<code bash> +
-# Obtener 5 nodos y lanzar un trabajo. +
-hpc-login2 ~]$ salloc -N5 myprogram +
-# Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso): +
-hpc-login2 ~]$ salloc -N1  +
-</code> +
-2. SRUN \\ +
-Sirve para lanzar un trabajo paralelo ( es preferible a usar mpirun ). Es interactivo y bloqueante. +
-<code bash> +
-# Lanzar un hostname en 2 nodos +
-hpc-login2 ~]$ srun -N2 hostname +
-hpc-node1 +
-hpc-node2 +
-</code> +
-3. SBATCH \\+
 Sirve para enviar un script al sistema de colas. Es de procesamiento por lotes y no bloqueante. Sirve para enviar un script al sistema de colas. Es de procesamiento por lotes y no bloqueante.
 <code bash> <code bash>
Liña 335: Liña 319:
 hpc-login2 ~]$ sbatch trabajo_ejemplo.sh  hpc-login2 ~]$ sbatch trabajo_ejemplo.sh 
 </code> </code>
 +2. SALLOC \\
 +Sirve para obtener de forma inmediata una asignación de recursos (nodos). En cuanto se obtiene se ejecuta el comando especificado o una shell en su defecto. 
 +<code bash>
 +# Obtener 5 nodos y lanzar un trabajo.
 +hpc-login2 ~]$ salloc -N5 myprogram
 +# Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso):
 +hpc-login2 ~]$ salloc -N1 
 +</code>
 +3. SRUN \\
 +Sirve para lanzar un trabajo paralelo ( es preferible a usar mpirun ). Es interactivo y bloqueante.
 +<code bash>
 +# Lanzar un hostname en 2 nodos
 +hpc-login2 ~]$ srun -N2 hostname
 +hpc-node1
 +hpc-node2
 +</code>
 +
  
 ==== Uso de los nodos con GPU ==== ==== Uso de los nodos con GPU ====