Se necesita tener instalado el paquete sun-java6-jdk:

sudo apt-get install sun-java6-jdk

Es necesario crear un enlace dinámico de las librerías jni.h y jni_md.h del paquete sun-java6-jdk a /usr/include:

sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-6-sun/include/jni.h /usr/include/
sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-6-sun/include/linux/jni_md.h /usr/include/

Son también necesarios tener instalados los paquetes swig autoconf automake y libtool:

$ sudo apt-get install swig autoconf automake libtool

umask 0022
cd /usr/src
wget http://www.physionet.org/physiotools/wfdb-swig.tar.gz
tar xzf wfdb-swig.tar.gz 
rm wfdb-swig.tar.gz
mv wfdb-swig-* wfdb-swig
cd wfdb-swig

Hay que editar el archivo Makefile y cambiar la primera linea de código:

MAKE = make WFDB_HOME=/usr

por

MAKE = make WFDB_HOME=/usr/local

despues:

make
make install