Táboa de Contidos

Catálogo de servicios del clúster HPC ctcomp2

(Volver a la Guía de usuario del clúster HPC ctcomp2)

Under continuous construction…

Compiladores

GCC

http://gcc.gnu.org/
Versión 
$ gcc --version gcc (Debian 4.7.2-4) 4.7.2
Módulo - (nativo del sistema)

<html> </html>

Java

http://www.java.com/es/download/
Versión 
$ java -versionjava version "1.7.0_07"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_07-b10)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.3-b01, mixed mode)
Módulo 
module load jdk

<html>

</html>

Python

http://www.python.org/
Versión 
$ python --versionPython 2.7.3rc2
Módulo - (nativo del sistema)
:!: Paquetes En en sistema solo está instalado el sistema base:
Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME
(Información en la página de documentación)

<html>

</html>

Librerías computacionales

MATLAB

http://www.mathworks.es/products/matlab/
Versión R2011a
R2012a
Módulo 
module load matlab/R2011a
module load matlab/R2012a
Versión por defecto: R2011a
(Hay más licencias 2011, como se explica en ATIC USC)
Comentarios Es posible que ejecuciones largas aparezca el siguiente warning:
Your MATLAB session has timed out. All license keys have been returned.
Aparentemente, este warning no afecta a las ejecuciones activas de MATLAB.

<html> </html>

Octave

http://www.mathworks.es/products/matlab/
Versión 3.6.2
Módulo - (nativo del sistema)
Comentarios En en sistema solo está instalado el sistema base:
Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME
(Información en la página de documentación)

<html> </html>

R

http://cran.r-project.org/
Versión 2.15.2
Módulo 
module load R/2.15.2
:!: Paquetes En en sistema solo está instalado el sistema base:
Los usuarios deben instalar otros paquetes en su $HOME.
(Información en la página de documentación)

<html> </html>

ACML (AMD Core Math Library)

http://developer.amd.com/tools/cpu-development/amd-core-math-library-acml/
Versión 5.2.0_64 gfortran (compilador GCC)
Módulo 
module load acml/5.2.0_64          
module load acmlacml/5.2.0_64_fma4     
module load acmlacml/5.2.0_64_mp       
module load acmlacml/5.2.0_64_mp_fma4
Versión por defecto: acml/5.2.0_64
Comentarios mp: multiprocessor
fma4: fused multiply–add (FMA) operations (wikipedia)
Versiones incompatibles (sólo uno de los módulos puede estar activo)
El frontend no soporta FMA4

<html> </html>

FFTW

http://fftw.org/
Versión 3.3.3
Módulo 
module load fftw

<html>

</html>

WFDB

http://www.physionet.org/physiotools/wfdb.shtml
Versión 10.5.18
Módulo 
module load wfdb

<html>

</html>

Liberías de paso de mensajes

Open MPI

http://www.open-mpi.org/
Versión 1.6.3
Módulo 
module load openmpi

<html>

</html>

MPICH

http://www.mpich.org
http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1-old/
Versiones MPICH2 1.4.1
MPICH1 1.2.7p1
Módulo 
module load mpich/1.4.1
mpich/1.2.7p1
Versión por defecto: mpich/1.4.1

<html>

</html>

Simuladores

TCAD-ATLAS (Silvaco)

http://www.silvaco.com/products/device_simulation/atlas.html
Versión 2012
Módulo 
module load silvaco-tcad

<html>

</html>

SENTAURUS (Synopsys)

http://www.synopsys.com/Tools/TCAD/Pages/default.aspx
Versiones D_2010.03 y G_2012.06-SP1
Módulo 
module load synopsys-sentaurus/D_2010.03
module load synopsys-sentaurus/G_2012.06-SP1
Versión por defecto: synopsys-sentaurus/D_2010.03

<html>

</html>

IC Design (CADENCE)

http://www.cadence.com/products/cic/Pages/default.aspx
Versiones 6.1.5 (2012-2013)
Módulo 
module load cadence
:!: Comentarios Antes de arrancar ocean es necesario ejecutar
source /optct/cadence/2012-2013/lnx86/cadence.bash
y arrancar ocean dentro de un entorno de X simulado
xvfb-run -a -n 80 -s “-screen 0 640x480x16” ocean < script.ocn
(Información en la página de documentación)

<html>

</html>

Administración

Modules

http://modules.sourceforge.net/
Versión 3.2.9c

PBS/TORQUE

http://www.adaptivecomputing.com/products/open-source/torque/
Versión 4.1.3